El zoológico mantiene y expone más de 120 especies de animales vivos, el 90% de ellos son nativos del Ecuador, que están ubicados en varias salas que recrean mediante instalaciones especiales los hábitat de cada especie, con la finalidad de que vivan en condiciones adecuadas, teniendo en cuenta los requerimientos básicos para la sobrevivencia en cautiverio y la necesidad de manejar las instalaciones bajo un marco educativo y estético.
En este sentido, el monitoreo y la investigación diaria es una de las prioridades que se toma para entender el comportamiento de cada animal en cautiverio
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